RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	CLRN2	A0PK11	232 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PRELP	P51888	382 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CACNB3	P54284	484 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	EVX2	Q03828	476 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAL	Q6DHV7	355 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	LPAR1	Q92633	364 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	MTMR8	Q96EF0	704 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF181	Q9P0P0	153 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	MYH4	Q9Y623	1939 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565		F5H6K3	240 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC1A4	P43007	532 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	USP14	P54578	494 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	KLRC3	Q07444	240 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM160B2	Q86V87	743 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	LAD1	O00515	517 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB5	O15062	677 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	GH2	P01242	217 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	BMP3	P12645	472 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	NLRP5	P59047	1200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SEPT2	Q15019	361 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	C19orf81	C9J6K1	198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SPTLC2	O15270	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CTAGE5	O15320	804 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FIBP	O43427	364 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CYTH3	O43739	400 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	GSE1	Q14687	1217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	STK38	Q15208	465 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	GPR162	Q16538	588 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	SCN4A	P35499	1836 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LPIN3-204	ENST00000496565	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	CAVIN2	O95810	425 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	NF2	P35240	595 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF445	P59923	1031 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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