RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP40-217ENST00000496298 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.1■■□□□ 1.29
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USP40-217ENST00000496298 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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USP40-217ENST00000496298 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.1■■□□□ 1.29
USP40-217ENST00000496298 MROH8Q9H579 483 aa23.1■■□□□ 1.29
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USP40-217ENST00000496298 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
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USP40-217ENST00000496298 A0A0D9SFI3 127 aa23.06■■□□□ 1.28
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USP40-217ENST00000496298 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP40-217ENST00000496298 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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USP40-217ENST00000496298 CYBAP13498 195 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP40-217ENST00000496298 GMCL1Q96IK5 515 aa22.99■■□□□ 1.27
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