RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496204.1

RAD50-208, Transcript of RAD50 double strand break repair protein, human

TSL 3

Gene RAD50, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD50-208	ENST00000496204	KCNN1	Q92952	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	GMIP	Q9P107	970 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD50-208	ENST00000496204	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CHRNE	Q04844	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CLC	Q05315	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SNX17	Q15036	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PEX10	O60683	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RAG1	P15918	1043 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	LINC00310	P59036	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	DLG4	P78352	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	DUSP4	Q13115	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RNF4	P78317	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NRDC	O43847	1150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SEMA7A	O75326	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	MLEC	Q14165	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CCNF	P41002	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CTSK	P43235	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	NUAK1	O60285	661 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	FKTN	O75072	461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	CLEC3A	O75596	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SYP	P08247	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ACR	P10323	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PDE6B	P35913	854 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	ITGAE	P38570	1179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD50-208	ENST00000496204	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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