RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.7□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYH4Q9Y623 1939 aa13.7□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 CTIFO43310 598 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 OGFRQ9NZT2 677 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 GJA5P36382 358 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 AK2P54819 239 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYCP1Q15431 976 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 BRF1Q92994 677 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 OTUD5Q96G74 571 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGXT2Q9BYV1 514 aa13.69□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM75PA6NK02 468 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTLL1O95922 423 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM87BQ96K49 555 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYL10Q9BUA6 226 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP17L5A8MUK1 530 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 IRF6O14896 467 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 NT5C2P49902 561 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPP2Q13103 211 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 WTAPQ15007 396 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 OPTNQ96CV9 577 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.68□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 RXRAP19793 462 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 HTRA3P83110 453 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 APOBRQ0VD83 1088 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MTMR2Q13614 643 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 DGKHQ86XP1 1220 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKS1AQ92625 1134 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 NYAP2Q9P242 653 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MTMR7Q9Y216 660 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTPRFP10586 1907 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.223e-7■■■□□ 16.6
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERO1BQ86YB8 467 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXL16Q8N461 479 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.67□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TCHHQ07283 1943 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERICH2A1L162 156 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIFRP42702 1097 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 PNMA1Q8ND90 353 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MKL1Q969V6 931 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 GINM1Q9NU53 330 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMX2Q9Y320 296 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 LARGE1O95461 756 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 APLP1P51693 650 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 MTA3Q9BTC8 594 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDR18Q9BV38 432 aa13.66□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBE2HP62256 183 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPATQ06203 517 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 TROAPQ12815 778 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 APOA5Q6Q788 366 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 KAT14Q9H8E8 782 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 UNCXA6NJT0 531 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAD21O60216 631 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMGCS2P54868 508 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 BACE1P56817 501 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 WNK4Q96J92 1243 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.65□□□□□ -0.22
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP17L10C9JJH3 530 aa13.64□□□□□ -0.23
TIMMDC1-208ENST00000494664 F5H6K3 240 aa13.64□□□□□ -0.23
TIMMDC1-208ENST00000494664 DTNBO60941 627 aa13.64□□□□□ -0.23
TIMMDC1-208ENST00000494664 NDUFB10O96000 172 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms