RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 MMP19Q99542 508 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 PGK1P00558 417 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 AKR1B1P15121 316 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 RAG1P15918 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 LCORLQ8N3X6 602 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 TINF2Q9BSI4 451 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CCER2I3L3R5 266 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0355O15063 1070 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 PGK2P07205 417 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 EPHB4P54760 987 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 KCTD2Q14681 263 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CCDC17Q96LX7 622 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 MYH8P13535 1937 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 GOLIM4O00461 696 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 RLBP1P12271 317 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PQY0 241 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 FPGSQ05932 587 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ARMT1Q9H993 441 aa25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 AKR1A1P14550 325 aa25.12■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 STAT3P40763 770 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 PARP14Q460N5 1801 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 TOX2Q96NM4 488 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 VWA5AO00534 786 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 PRKAB2O43741 272 aa25.1■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 CDK8P49336 464 aa25.1■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 GRIN2CQ14957 1233 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 C12orf60Q5U649 245 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 GOPCQ9HD26 462 aa25.09■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS4O75173 837 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 ACLYP53396 1101 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-210ENST00000491139 FAAP100Q0VG06 881 aa25.08■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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NELFE-210ENST00000491139 USP17L21D6R901 530 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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NELFE-210ENST00000491139 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.06■■□□□ 1.6
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NELFE-210ENST00000491139 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.06■■□□□ 1.6
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NELFE-210ENST00000491139 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 ZNF576Q9H609 170 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.06■■□□□ 1.6
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NELFE-210ENST00000491139 TIMP1P01033 207 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 ADD2P35612 726 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 REPS2Q8NFH8 660 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 TIFAQ96CG3 184 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.67e-9■■■■□ 20.6
NELFE-210ENST00000491139 BCL11AQ9H165 835 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 KCNA10Q16322 511 aa25.04■■□□□ 1.6
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