RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC51AQ86UW1 340 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 RNF112Q9ULX5 631 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 NUDCQ9Y266 331 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 MYH3P11055 1940 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 CLGNO14967 610 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 ALX3O95076 343 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SRGNP10124 158 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM193AP78312 1265 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 RNF181Q9P0P0 153 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 USTQ9Y2C2 406 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SPEF2Q9C093 1822 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 PCNTO95613 3336 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TOMM70O94826 608 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SETDB1Q15047 1291 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 OCLNQ16625 522 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 C16orf46Q6P387 395 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TTLL6Q8N841 843 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 CACNA1FO60840 1977 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SCN9AQ15858 1988 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 F8W735 103 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 LMNB1P20700 586 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 RALBP1Q15311 655 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 CRY2Q49AN0 593 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 STYK1Q6J9G0 422 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 CNBD1Q8NA66 436 aa7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 H0YIN7 160 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 PDE6BP35913 854 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 PROSER3Q2NL68 480 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 OLFM4Q6UX06 510 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 SETDB2Q96T68 719 aa7.65□□□□□ -1.18
JMJD1C-208ENST00000490669 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 GLTPD2A6NH11 291 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 NTSR2O95665 410 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 FSTP19883 344 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 MMP14P50281 582 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 KRT24Q2M2I5 525 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM26DQ5JW98 314 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 TMTC2Q8N394 836 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 STK32AQ8WU08 396 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 COL26A1Q96A83 441 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 MUC3BQ9H195 1237 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 PPME1Q9Y570 386 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 CHL1O00533 1208 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 GLB1P16278 677 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 HTRA3P83110 453 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZS46 218 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 OR13H1Q8NG92 308 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 MASTLQ96GX5 879 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 TNFRSF10BO14763 440 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 BRD1O95696 1058 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ANXA1P04083 346 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF853P0CG23 659 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 NPR1P16066 1061 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 RIPK4P57078 832 aa7.62□□□□□ -1.19
JMJD1C-208ENST00000490669 ST5P78524 1137 aa7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms