RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC41Q15345 812 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 BADQ92934 168 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SH2D4AQ9H788 454 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 EYSQ5T1H1 3165 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 RAD21O60216 631 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 HMMRO75330 724 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 PGK2P07205 417 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 RAB11FIP3O75154 756 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 ATP5JP18859 108 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC17Q96LX7 622 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 MMP19Q99542 508 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SLC25A27O95847 323 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 MS4A1P11836 297 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 HAUS7Q99871 368 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 MYH7P12883 1935 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SNX17Q15036 470 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 CTR9Q6PD62 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 UBE3CQ15386 1083 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 PGK1P00558 417 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 STAT3P40763 770 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 TLE2Q04725 743 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 TINF2Q9BSI4 451 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 GOPCQ9HD26 462 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 VWA5AO00534 786 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 RARBP10826 455 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 KCTD2Q14681 263 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 PHF24Q9UPV7 400 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ITGB8P26012 769 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 REPS2Q8NFH8 660 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A3P48751 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 RNF180Q86T96 592 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PQY0 241 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CLTBP09497 229 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 EPHB4P54760 987 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 RIPK3Q9Y572 518 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CDH23Q9H251 3354 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 AKR1A1P14550 325 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 RASA1P20936 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MYLIPQ8WY64 445 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 F5H6K3 240 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 KLRC3Q07444 240 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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