RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.05□□□□□ -1.28
PTEN-204ENST00000487939 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.05□□□□□ -1.28
PTEN-204ENST00000487939 PRR13Q9NZ81 148 aa7.05□□□□□ -1.28
PTEN-204ENST00000487939 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.05□□□□□ -1.28
PTEN-204ENST00000487939 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTEN-204ENST00000487939 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTEN-204ENST00000487939 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
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PTEN-204ENST00000487939 TCEAL1Q15170 157 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTEN-204ENST00000487939 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTEN-204ENST00000487939 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.98□□□□□ -1.29
PTEN-204ENST00000487939 PPM1BO75688 479 aa6.97□□□□□ -1.29
PTEN-204ENST00000487939 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTEN-204ENST00000487939 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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