RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 SLC27A2O14975 620 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 CNMDO75829 334 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 GNRH1P01148 92 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 DSG3P32926 999 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 NECTIN1Q15223 517 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ATG4CQ96DT6 458 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 GMCL1Q96IK5 515 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TTC14Q96N46 770 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 DGKHQ86XP1 1220 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 NCOA7Q8NI08 942 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 BTBD7Q9P203 1132 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TNKSO95271 1327 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRN-216ENST00000486480 BMP3P12645 472 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 MB21D1Q8N884 522 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PLXNB2O15031 1838 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRN-216ENST00000486480 SLC1A4P43007 532 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 Q3C1V9 767 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 RNF20Q5VTR2 975 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 MTMR7Q9Y216 660 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 REC8O95072 547 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 DCAF4Q8WV16 495 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ANKS1AQ92625 1134 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PORCNQ9H237 461 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 SRRDQ9UH36 339 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 FEM1BQ9UK73 627 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 HOXD10P28358 340 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PRMT2P55345 433 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 CCNA1P78396 465 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC96Q2M329 555 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ABHD8Q96I13 439 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM232C9JQI7 657 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 VWA5AO00534 786 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 MAPK4P31152 587 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 STAT2P52630 851 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PRKCZQ05513 592 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 SEC23AQ15436 765 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 KCTD1Q719H9 257 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRN-216ENST00000486480 COA7Q96BR5 231 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 KAT14Q9H8E8 782 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PDHBP11177 359 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ANTXR2P58335 489 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 FAM160B2Q86V87 743 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA1Q8ND90 353 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 REPS2Q8NFH8 660 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 GABRQQ9UN88 632 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRN-216ENST00000486480 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 SNHG28P0DPA3 235 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 PLS1Q14651 629 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 CHST3Q7LGC8 479 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 ERICH2A1L162 156 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 PLA2G6O60733 806 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 FLT3LGP49771 235 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 GPR142Q7Z601 462 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 RASEFQ8IZ41 740 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 HTTP42858 3142 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 MCM5P33992 734 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 HSPA4P34932 840 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF543Q08ER8 600 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 WDR78Q5VTH9 848 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-216ENST00000486480 RAET1EQ8TD07 263 aa22.43■■□□□ 1.18
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