RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa19.17■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 SRGAP3O43295 1099 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 FCER1AP12319 257 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 CSF2RAP15509 400 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 RASIP1Q5U651 963 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF365Q70YC5 407 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 MB21D1Q8N884 522 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.16■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 ACRP10323 421 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 AKR1A1P14550 325 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 USP5P45974 858 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 KCNQ1P51787 676 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 ACLYP53396 1101 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.15■□□□□ 0.66
SRPRB-204ENST00000484684 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 TINF2Q9BSI4 451 aa19.14■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 EHD4Q9H223 541 aa19.14■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 XIRP2A4UGR9 3374 aa19.14■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 MOXD2PA6NHM9 499 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ADAMTS4O75173 837 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ROBO3Q96MS0 1386 aa19.13■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SEPT2Q15019 361 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 TTC6Q86TZ1 520 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 MMP19Q99542 508 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 A0A0G2JMZ2 1700 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 FLOT1O75955 427 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 PGK2P07205 417 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 CYP7A1P22680 504 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 DSG3P32926 999 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 KCNA10Q16322 511 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 PPP2R2DQ66LE6 453 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 HERVK_113Q902F9 699 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ATG4CQ96DT6 458 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 MYH1P12882 1939 aa19.11■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ERC2O15083 957 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SLC25A27O95847 323 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 GUCY1A2P33402 732 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 KCTD2Q14681 263 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 MIGA1Q8NAN2 632 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 IL23AQ9NPF7 189 aa19.1■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ELP1O95163 1332 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 A0A1W2PRG0 241 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 FGBP02675 491 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 SHMT1P34896 483 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SRPRB-204ENST00000484684 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 CERS3Q8IU89 383 aa19.08■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.08■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 FAM184BQ9ULE4 1060 aa19.08■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 FAM86C2PA6NEL3 165 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 GPR37L1O60883 481 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 IGSF3O75054 1194 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 CYP2C18P33260 490 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 CDK7P50613 346 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 RABGGTBP53611 331 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM132BQ14DG7 1078 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 OTOP2Q7RTS6 562 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.07■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 MYADML2A6NDP7 307 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 ARVCFO00192 962 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 ZAP70P43403 619 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 PLCD1P51178 756 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 MTX1Q13505 466 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 SPC25Q9HBM1 224 aa19.06■□□□□ 0.64
SRPRB-204ENST00000484684 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms