RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482874.1

SLC22A23-208, Transcript of solute carrier family 22 member 23, human

TSL 3

Gene SLC22A23, Length 622 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC22A23-208	ENST00000482874	ATG4C	Q96DT6	458 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	STX8	Q9UNK0	236 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	MAPK4	P31152	587 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	COA7	Q96BR5	231 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	CYP21A2	P08686	494 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	FLT3LG	P49771	235 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLFN13	Q68D06	897 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	TTC14	Q96N46	770 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	BRCA2	P51587	3418 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	RAD21	O60216	631 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	CAPN15	O75808	1086 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCNA1	P78396	465 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF333	Q96JL9	665 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874		B4E1Z4	1266 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	VWA5A	O00534	786 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	KDM4A	O75164	1064 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	GPR142	Q7Z601	462 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	USP6NL	Q92738	828 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	KRT23	Q9C075	422 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	CDC45	O75419	566 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	BMP3	P12645	472 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	FEM1B	Q9UK73	627 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	PLA2G6	O60733	806 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	GRK4	P32298	578 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	MORN1	Q5T089	497 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	DGKH	Q86XP1	1220 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	ANKS1A	Q92625	1134 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SLC22A23-208	ENST00000482874	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	MCC	P23508	829 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	IQCA1	Q86XH1	822 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874		E7EWF7	191 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ADCY3	O60266	1144 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC1A4	P43007	532 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SNHG28	P0DPA3	235 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	PTPRE	P23469	700 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	GRB14	Q14449	540 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	NECTIN1	Q15223	517 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	TMEM232	C9JQI7	657 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ERCC3	P19447	782 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	RGS19	P49795	217 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	STAT2	P52630	851 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	CASC1	Q6TDU7	716 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	FAM160B2	Q86V87	743 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	MROH8	Q9H579	483 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	TNKS	O95271	1327 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SLC25A27	O95847	323 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	PDHB	P11177	359 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	ELN	P15502	786 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	SEC23A	Q15436	765 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC22A23-208	ENST00000482874	KCTD1	Q719H9	257 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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