RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482128.1

SEMA4D-218, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-218ENST00000482128 CETPP11597 493 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 BMP3P12645 472 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 VCAM1P19320 739 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 GNAQP50148 359 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 BECN1Q14457 450 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 FANCBQ8NB91 859 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SEMA4D-218ENST00000482128 RASSF10A6NK89 507 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 RXRAP19793 462 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 ZNF543Q08ER8 600 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 STK3Q13188 491 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 ME3Q16798 604 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.7■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 GTF3C6Q969F1 213 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 TMX3Q96JJ7 454 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.69■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CPLX1O14810 134 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CCL15Q16663 113 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CDKL5O76039 1030 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 LARGE1O95461 756 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 SCRN1Q12765 414 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 KCTD1Q719H9 257 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 FEM1BQ9UK73 627 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.67■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L15C9J2P7 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 TMEM232C9JQI7 657 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L11C9JVI0 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 KLRF2D3W0D1 207 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L18D6R9N7 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L22D6RA61 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L19D6RCP7 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L20D6RJB6 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 STAT2P52630 851 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 USP17L24Q0WX57 530 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 DGKZQ13574 1117 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 FAM160B2Q86V87 743 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.66■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 PLA2G6O60733 806 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 INHBEP58166 350 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 C1QTNF8P60827 252 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 SREBF2Q12772 1141 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 NOGQ13253 232 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 GRM1Q13255 1194 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 NECAB1Q8N987 351 aa22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SEMA4D-218ENST00000482128 SMARCA1P28370 1054 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 CDC27P30260 824 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 CAPNS2Q96L46 248 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 PNMA3Q9UL41 463 aa22.64■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 FLOT1O75955 427 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 MOGSQ13724 837 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 TREML2Q5T2D2 321 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.63■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 HSPA6P17066 643 aa22.62■■□□□ 1.21
SEMA4D-218ENST00000482128 IFNAR1P17181 557 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms