RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 CCNA1P78396 465 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 IRF5Q13568 498 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SLFN13Q68D06 897 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 GPR142Q7Z601 462 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 NBPF11Q86T75 865 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 MB21D1Q8N884 522 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 HTTP42858 3142 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 GRK4P32298 578 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 ESR2Q92731 530 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 MYH4Q9Y623 1939 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 ADCY3O60266 1144 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SOX10P56693 466 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 VWA5AO00534 786 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 BMP3P12645 472 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 NT5C2P49902 561 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 MAP4K1Q92918 833 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 GMCL1Q96IK5 515 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 LAMA4Q16363 1823 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 KDM4AO75164 1064 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 CYP21A2P08686 494 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 MORN1Q5T089 497 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 REPS2Q8NFH8 660 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 USP6NLQ92738 828 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 FEM1BQ9UK73 627 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 PARP14Q460N5 1801 aa24.7■■□□□ 1.55
ACTB-211ENST00000480301 B4E1Z4 1266 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ELNP15502 786 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MCCP23508 829 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 RGS19P49795 217 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TTC14Q96N46 770 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ERCC3P19447 782 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CYP2B6P20813 491 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A4P43007 532 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 KRT23Q9C075 422 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 PLXNB2O15031 1838 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM232C9JQI7 657 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 PTPREP23469 700 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 PLS1Q14651 629 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MTFR1Q15390 333 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 WDR78Q5VTH9 848 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 STAT3P40763 770 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 KCTD1Q719H9 257 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 DGKHQ86XP1 1220 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 KIFC2Q96AC6 838 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 POTEFA5A3E0 1075 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G6O60733 806 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CDC45O75419 566 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K5Q13163 448 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 IQCA1Q86XH1 822 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 DCAF4Q8WV16 495 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ANKS1AQ92625 1134 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MROH8Q9H579 483 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 MTMR7Q9Y216 660 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ZBED4O75132 1171 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A27O95847 323 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 INHAP05111 366 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 RGS2P41220 211 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 UBXN2AP68543 259 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 GRB14Q14449 540 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 FAM160B2Q86V87 743 aa24.65■■□□□ 1.54
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