RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NBPF3Q9H094 633 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 POLR2MP0CAP2 368 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 USH1GQ495M9 461 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SYNE4Q8N205 404 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 RFX1P22670 979 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CNGA4Q8IV77 575 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NOX5Q96PH1 765 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NARFQ9UHQ1 456 aa15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PRKAB2O43741 272 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 FSD2A1L4K1 749 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 STX10O60499 249 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PDE4DQ08499 809 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 LCORLQ8N3X6 602 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 GLG1Q92896 1179 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 DDAH1O94760 285 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 USP17L3A6NCW0 530 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 USP17L4A6NCW7 530 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ZEB2O60315 1214 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CLIC4Q9Y696 253 aa15.17■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 KRT83P78385 493 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 FOXO4P98177 505 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PNOCQ13519 176 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 VWA3BQ502W6 1294 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 FBXO11Q86XK2 927 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CCDC42Q96M95 316 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SERTAD1Q9UHV2 236 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 FLOT1O75955 427 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ALAS1P13196 640 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CALCRLQ16602 461 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SCG2P13521 617 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 KIF2CQ99661 725 aa15.16■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 VPS72Q15906 364 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SLFN13Q68D06 897 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 PNMA3Q9UL41 463 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 BLIDQ8IZY5 108 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 CSRNP1Q96S65 589 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PQ27 194 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PQ64 194 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PQD8 194 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SMCO2A6NFE2 343 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 GAS7O60861 476 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 VPS16Q9H269 839 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 NDUFA8P51970 172 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.15■□□□□ 0.02
NISCH-207ENST00000479054 KRT86O43790 486 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-207ENST00000479054 STAMBPO95630 424 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-207ENST00000479054 PAK1Q13153 545 aa15.14■□□□□ 0.01
NISCH-207ENST00000479054 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms