RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJC18Q9H819 358 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 THEGQ9P2T0 379 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SWAP70Q9UH65 585 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF112Q9UJU3 913 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM196BA6NMK8 535 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC27A2O14975 620 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SHMT1P34896 483 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 HSPA4P34932 840 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 CDK8P49336 464 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 TATDN1Q6P1N9 297 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-207ENST00000471650 RLFQ13129 1914 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 LAMA4Q16363 1823 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PCP11498 1178 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PDE4BQ07343 736 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 TSGA10IPQ3SY00 556 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RNF20Q5VTR2 975 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 TBC1D10CQ8IV04 446 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 STAG1Q8WVM7 1258 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 COA7Q96BR5 231 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF287Q9HBT7 754 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 INCENPQ9NQS7 918 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 WDFY4Q6ZS81 3184 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ORC4O43929 436 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 MCCP23508 829 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 EPHB4P54760 987 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 MFSD6Q6ZSS7 791 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 E7EWF7 191 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PEX10O60683 326 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PRDM1O75626 825 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RASA1P20936 1047 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 MRE11P49959 708 aa12.68□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 GADL1Q6ZQY3 521 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 STOX1Q6ZVD7 989 aa12.68□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 RASEFQ8IZ41 740 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 BADQ92934 168 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC17Q96LX7 622 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 MYH8P13535 1937 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CXCL11O14625 94 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 BMP1P13497 986 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAJB2P25686 324 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CAP2P40123 477 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 NT5C2P49902 561 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 ADGRE1Q14246 886 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 TREML2Q5T2D2 321 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 KRT23Q9C075 422 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 DOCK1Q14185 1865 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 AKR1B1P15121 316 aa12.66□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 KRT32Q14532 448 aa12.66□□□□□ -0.38
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SH3BP1-207ENST00000471650 ABCB5Q2M3G0 1257 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 NCOA7Q8NI08 942 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 IL17RAQ96F46 866 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 TOMM22Q9NS69 142 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 GH2P01242 217 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-207ENST00000471650 CYP2B6P20813 491 aa12.65□□□□□ -0.38
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