RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 SBK1Q52WX2 424 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 TDHQ8IZJ6 230 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 APPBP2Q92624 585 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 MAML3Q96JK9 1138 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 MMP19Q99542 508 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 VWA5AO00534 786 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT4O43236 478 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 RASA1P20936 1047 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 APPP05067 770 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 STAT3P40763 770 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 KBTBD13C9JR72 458 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 GPAA1O43292 621 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 PGK2P07205 417 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 TDO2P48775 406 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 KCTD2Q14681 263 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 RLFQ13129 1914 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 M0R2C6 588 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 RTP1P59025 263 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 NYAP2Q9P242 653 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.02■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 F5H6K3 240 aa23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 GNAT2P19087 354 aa23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 KLRC3Q07444 240 aa23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 A0A0G2JMZ2 1700 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PRDM1O75626 825 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SLC4A3P48751 1232 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 FAM47AQ5JRC9 791 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 GPR153Q6NV75 609 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 Q7L0L9 218 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 DEFB123Q8N688 67 aa23■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 REPS2Q8NFH8 660 aa23■■□□□ 1.27
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SHQ1-206ENST00000471526 NDUFB10O96000 172 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC41Q15345 812 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 FERMT2Q96AC1 680 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 TINF2Q9BSI4 451 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.99■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 COPB2P35606 906 aa22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 MYH8P13535 1937 aa22.98■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ERC2O15083 957 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 RARBP10826 455 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 CPXCR1Q8N123 301 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.97■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM60Q495X7 471 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 KIFC2Q96AC6 838 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 DDX11Q96FC9 970 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 CEP95Q96GE4 821 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 FSD1Q9BTV5 496 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 RIPK3Q9Y572 518 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 MYH7P12883 1935 aa22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-206ENST00000471526 ZBED4O75132 1171 aa22.95■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 PGK1P00558 417 aa22.95■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.95■■□□□ 1.26
SHQ1-206ENST00000471526 LAMA3Q16787 3333 aa22.95■■□□□ 1.26
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