RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471438.2

CSMD2-208, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 2, human

TSL 5

Gene CSMD2, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD2-208	ENST00000471438	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CSMD2-208	ENST00000471438	KANK1	Q14678	1352 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CSMD2-208	ENST00000471438	TNR	Q92752	1358 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CSMD2-208	ENST00000471438	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CSMD2-208	ENST00000471438	EREG	O14944	169 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CTSB	P07858	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	OXCT1	P55809	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	IKZF1	Q13422	519 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GJD3	Q8N144	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CYP11A1	P05108	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	LINC00310	P59036	64 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NFIX	Q14938	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	POU4F3	Q15319	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGRB2	O60241	1585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GLI3	P10071	1580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		E9PSI1	815 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NEFM	P07197	916 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	BMP7	P18075	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ITIH2	P19823	946 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GLDC	P23378	1020 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PLIN1	O60240	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ICMT	O60725	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	IGHA2	P01877	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	HTRA3	P83110	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GPR162	Q16538	588 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	RREB1	Q92766	1687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	SERPINB4	P48594	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KCNN1	Q92952	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		A0A096LPE4	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NDUFB5	O43674	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	AOC2	O75106	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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