RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 GJD2Q9UKL4 321 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 STX8Q9UNK0 236 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 ADCY3O60266 1144 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 NMT2O60551 498 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 LAMA4Q16363 1823 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PARP14Q460N5 1801 aa23.53■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 GPR142Q7Z601 462 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.52■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 SGSM2O43147 1006 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 WDR78Q5VTH9 848 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SLFN13Q68D06 897 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.51■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 ELNP15502 786 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 NOVP48745 357 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 ESR2Q92731 530 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 NEDD4P46934 1319 aa23.5■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 PLXNB2O15031 1838 aa23.49■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 NT5C2P49902 561 aa23.49■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 UBXN2AP68543 259 aa23.49■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 PLS1Q14651 629 aa23.49■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 POTEFA5A3E0 1075 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 VWA5AO00534 786 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 BMP3P12645 472 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2B6P20813 491 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MORN1Q5T089 497 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 GMCL1Q96IK5 515 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.48■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 INHAP05111 366 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 PTPREP23469 700 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 PTH1RQ03431 593 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MTFR1Q15390 333 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 USP6NLQ92738 828 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 FEM1BQ9UK73 627 aa23.47■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 ERCC3P19447 782 aa23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MCCP23508 829 aa23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 RGS2P41220 211 aa23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SLC1A4P43007 532 aa23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 MROH8Q9H579 483 aa23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTPS1-206ENST00000470271 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 HMGCRP04035 888 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CCL5P13501 91 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 MAP2K5Q13163 448 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 GRB14Q14449 540 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 REPS2Q8NFH8 660 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 KIFC2Q96AC6 838 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TTC14Q96N46 770 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 B4E1Z4 1266 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM232C9JQI7 657 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 STRNO43815 780 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 KDM4AO75164 1064 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A27O95847 323 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 STAT3P40763 770 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 IQCA1Q86XH1 822 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 APBA2Q99767 749 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 KRT23Q9C075 422 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.44■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZBED4O75132 1171 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 STAT2P52630 851 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TRIB2Q92519 343 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 MAP4K1Q92918 833 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms