RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	EYA2	O00167	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ARVCF	O00192	962 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GH2	P01242	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	KCNA5	P22460	613 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ADORA1	P30542	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ELP1	O95163	1332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CD4	P01730	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TCF15	Q12870	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	PGK2	P07205	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	ASGR1	P07306	291 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	RALBP1	Q15311	655 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.52	□□□□□ -0.24
HCLS1-204	ENST00000468693	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	PLS1	Q14651	629 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	SCLY	Q96I15	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF536	O15090	1300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	VAMP4	O75379	141 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	USP14	P54578	494 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	MROH8	Q9H579	483 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ADCY6	O43306	1168 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	FCER1A	P12319	257 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ZP2	Q05996	745 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	SIL1	Q9H173	461 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	FLT1	P17948	1338 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	COG2	Q14746	738 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIO	O75962	3097 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	RGS20	O76081	388 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	LDHC	P07864	332 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	GSTO1	P78417	241 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	MMP19	Q99542	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-204	ENST00000468693	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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