RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SGIP1-208	ENST00000468570		K7ESM1	405 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SLURP1	P55000	103 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TREH	O43280	583 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	NRDC	O43847	1150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MAPK1	P28482	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNC1	P48547	511 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TNNI2	P48788	182 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	HMGA2	P52926	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PLCG1	P19174	1290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	LMNB1	P20700	586 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570		Q8N1X5	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CNR2	P34972	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CAP1	Q01518	475 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MEIS1	O00470	390 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	DNAJA2	O60884	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ACVRL1	P37023	503 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MC3R	P41968	323 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RTP1	P59025	263 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ITGB3	P05106	788 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SYP	P08247	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PNLIP	P16233	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PRKCA	P17252	672 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	LIG3	P49916	1009 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	PDE4B	Q07343	736 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	KIF2C	Q99661	725 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGIP1-208	ENST00000468570	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75

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