RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 EBF1Q9UH73 591 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAMEF1O95521 474 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TEKQ02763 1124 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNMB1Q16558 191 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 GPRASP2Q96D09 838 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 MEIS1O00470 390 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 CCNFP41002 786 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 AFMP43652 599 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TCTN2Q96GX1 697 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 KIRREL1Q96J84 757 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 IMPDH2P12268 514 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 GJA8P48165 433 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SOX9P48436 509 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ZPBP2Q6X784 338 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SP110Q9HB58 689 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 DCAF15Q66K64 600 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TM9SF2Q99805 663 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SHOXO15266 292 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 SIGLEC6O43699 453 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 FKTNO75072 461 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 HPXP02790 462 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 GUCY2CP25092 1073 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 GALK1P51570 392 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 MYLIPQ8WY64 445 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNK12Q9HB15 430 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 CHST7Q9NS84 486 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TCFL5Q9UL49 500 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM82A0PJX8 343 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 GLI1P08151 1106 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SYPP08247 313 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CTSKP43235 329 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 MLANAQ16655 118 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 BBS9Q3SYG4 887 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ABHD4Q8TB40 342 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC120Q96HB5 630 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 EFEMP2O95967 443 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 GIPRP48546 466 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CRBNQ96SW2 442 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF32Q9H0A6 362 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 RAC2P15153 192 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 FBLN7Q53RD9 439 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms