RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf229H3BNL8 230 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY5O95622 1261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SCG2P13521 617 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCA1P28370 1054 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP5P45974 858 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 GRIN1Q05586 938 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PODNQ7Z5L7 613 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SLF2Q8IX21 1173 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA1Q8ND90 353 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA20Q8TB22 786 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 MXD3Q9BW11 206 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 EHD4Q9H223 541 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TOMM22Q9NS69 142 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP25Q9UHP3 1055 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TSPY2A6NKD2 308 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KIF3CO14782 793 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KINO60870 393 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF202O95125 648 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KCNA3P22001 575 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SHMT1P34896 483 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 NCAPHQ15003 741 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 STX1AQ16623 288 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 MSL1Q68DK7 614 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 LUZP1Q86V48 1076 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC18Q9H819 358 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 H0YIN7 160 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 NFIAQ12857 509 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 USP49Q70CQ1 688 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 CNKSR1Q969H4 720 aa6.49□□□□□ -1.37
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