RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457647.2

RGPD4-AS1-202, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGPD4-AS1, Length 1,792 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SNAPC2Q13487 334 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ANKRD1Q15327 319 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 C12orf42Q96LP6 360 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AOC2O75106 756 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLC1A4P43007 532 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 USP14P54578 494 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GRM4Q14833 912 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCDC96Q2M329 555 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CAPNS2Q96L46 248 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MYH6P13533 1939 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PPFIA3O75145 1194 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF543Q08ER8 600 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCL15Q16663 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NBPF11Q86T75 865 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FANCBQ8NB91 859 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DCAF4Q8WV16 495 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCDC102AQ96A19 550 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GMCL1Q96IK5 515 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PTPN18Q99952 460 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PFKFB2O60825 505 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BMP3P12645 472 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLC16A2P36021 539 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GTF2A2P52657 109 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SCRN1Q12765 414 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LPAR1Q92633 364 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMX3Q96JJ7 454 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NID2Q14112 1375 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMEM232C9JQI7 657 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HSPA6P17066 643 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RTN1Q16799 776 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SNX21Q969T3 373 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BTBD19C9JJ37 291 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CETPP11597 493 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 VEGFBP49765 207 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GTF3C6Q969F1 213 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KLRF2D3W0D1 207 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CYTH3O43739 400 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CALM1P0DP23 149 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CALM2P0DP24 149 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CALM3P0DP25 149 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RCAN1P53805 252 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SNAP25P60880 206 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MAP3K14Q99558 947 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CTDNEP1O95476 244 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MCM2P49736 904 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FUT2Q10981 343 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 NTRK3Q16288 839 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PEX10O60683 326 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FLOT1O75955 427 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms