RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-204ENST00000444685 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CBX1-204ENST00000444685 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CBX1-204ENST00000444685 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-204ENST00000444685 ALPK3Q96L96 1907 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RAG1P15918 1043 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ABL2P42684 1182 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MAP3K12Q12852 859 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MTMR2Q13614 643 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MORN1Q5T089 497 aa6.33□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 LCE2CQ5TA81 110 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.33□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 GINM1Q9NU53 330 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 USP17L11C9JVI0 530 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 USP17L18D6R9N7 530 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 USP17L20D6RJB6 530 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 KDM4AO75164 1064 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 CCL14Q16627 93 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 AAK1Q2M2I8 961 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 Q3C1V9 767 aa6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 GRIN2CQ14957 1233 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 TIFAQ96CG3 184 aa6.31□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RAI14Q9P0K7 980 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 THEGQ9P2T0 379 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.31□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CLTBP09497 229 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 HOXC6P09630 235 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SLURP2P0DP57 97 aa6.3□□□□□ -1.4
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