RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TCP10Q12799 353 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 GRAPQ13588 217 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 NPY5RQ15761 445 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TEX35Q5T0J7 233 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 IQUBQ8NA54 791 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 COA7Q96BR5 231 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MYH3P11055 1940 aa22.27■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MYH7P12883 1935 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM260Q9NX78 707 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MARCH6O60337 910 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 DDAH1O94760 285 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 GGA1Q9UJY5 639 aa22.26■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CASP14P31944 242 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 WDR24Q96S15 920 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CD209Q9NNX6 404 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CYTH3O43739 400 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SLC16A2P36021 539 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TXLNAP40222 546 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TECP42680 631 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TXKP42681 527 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 PIGSQ96S52 555 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TFR2Q9UP52 801 aa22.25■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 XDHP47989 1333 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 KANK3Q6NY19 840 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ST7Q9NRC1 585 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 FAM170AA1A519 330 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 NELFBQ8WX92 580 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 USP17L5A8MUK1 530 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CDK8P49336 464 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 VPS72Q15906 364 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SOGA3Q5TF21 947 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CEP95Q96GE4 821 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MTRQ99707 1265 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SMCO2A6NFE2 343 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TC2NQ8N9U0 490 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 UBXN4Q92575 508 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 POLLQ9UGP5 575 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SNAP25P60880 206 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 DYMQ7RTS9 669 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.157e-12■□□□□ 9.8
TTLL3-210ENST00000427220 FERMT2Q96AC1 680 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.22■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 IDEP14735 1019 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CASQ1P31415 396 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC96Q2M329 555 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ORC4O43929 436 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ST5P78524 1137 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 RASA1P20936 1047 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TNNI2P48788 182 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 UBXN1Q04323 297 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM47Q96LD4 638 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 HINFPQ9BQA5 517 aa22.21■■□□□ 1.15
TTLL3-210ENST00000427220 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA1Q5VX52 437 aa22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 ABL1P00519 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.2■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SEMA3EO15041 775 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 FANCGO15287 622 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 LDHCP07864 332 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 PRCPP42785 496 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-210ENST00000427220 KLHL34Q8N239 644 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms