RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G6O60733 806 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP3P12645 472 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DSG3P32926 999 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC1A4P43007 532 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF4Q8WV16 495 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FEM1BQ9UK73 627 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNKSO95271 1327 aa17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERICH2A1L162 156 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FDX1P10109 184 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXD10P28358 340 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRMT2P55345 433 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCGRTP55899 365 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNA1P78396 465 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM160B2Q86V87 743 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNB2Q92953 911 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KAT14Q9H8E8 782 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFCC1Q9HA90 598 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF6LQ9Y6J9 622 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHIPQ8WWQ0 1821 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPA4P34932 840 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK-9P63128 1117 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK-24P63145 666 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNHG28P0DPA3 235 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCCP23508 829 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPK4P31152 587 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCM5P33992 734 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMC4P43686 418 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAT2P52630 851 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC23AQ15436 765 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNMA1Q8ND90 353 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM87BQ96K49 555 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM17Q9Y577 477 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDHBP11177 359 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMTC2Q8N394 836 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATG4CQ96DT6 458 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK1Q96PY6 1258 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATAD5Q96QE3 1844 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM232C9JQI7 657 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VWA5AO00534 786 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNMDO75829 334 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COPB2P35606 906 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COA7Q96BR5 231 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM47Q96LD4 638 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP26Q9BXU7 913 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTBD7Q9P203 1132 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP2A1O14983 1001 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRC1O43663 620 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBED4O75132 1171 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OAZ1P54368 228 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANTXR2P58335 489 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF543Q08ER8 600 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WTAPQ15007 396 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC96Q2M329 555 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q3C1V9 767 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASEFQ8IZ41 740 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPOCK2Q92563 424 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRRDQ9UH36 339 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A27O95847 323 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMA5P28066 241 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIFRP42702 1097 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms