RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	MTMR7	Q9Y216	660 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	BMP3	P12645	472 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	TM4SF4	P48230	202 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	RCAN1	P53805	252 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	APOA5	Q6Q788	366 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L15	C9J2P7	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	BTBD19	C9JJ37	291 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L11	C9JVI0	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L18	D6R9N7	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L22	D6RA61	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L19	D6RCP7	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L20	D6RJB6	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ST18	O60284	1047 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	USP17L24	Q0WX57	530 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	TROAP	Q12815	778 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC96	Q2M329	555 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ZIC5	Q96T25	663 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	AK2	P54819	239 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	EVC	P57679	992 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	APOBR	Q0VD83	1088 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	IFNL1	Q8IU54	200 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB43	O43298	467 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF543	Q08ER8	600 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PTPN18	Q99952	460 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	PDHX	O00330	501 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	OSBP	P22059	807 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	KIF5B	P33176	963 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	GRM4	Q14833	912 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	FEM1B	Q9UK73	627 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
GKAP1-204	ENST00000388782	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	ALDH1A1	P00352	501 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PLA2G6	O60733	806 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	STAT2	P52630	851 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM160B2	Q86V87	743 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	MYPN	Q86TC9	1320 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	NID2	Q14112	1375 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	FLOT1	O75955	427 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	MCM2	P49736	904 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	GNAQ	P50148	359 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	COG2	Q14746	738 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	RTN1	Q16799	776 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	RXRA	P19793	462 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GKAP1-204	ENST00000388782	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21

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