RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 KRT9P35527 623 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PTPROQ16827 1216 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SLFN13Q68D06 897 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC175P0C221 793 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PP2D1A8MPX8 630 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SPAG1Q07617 926 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 USP49Q70CQ1 688 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 FERMT2Q96AC1 680 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PLCD1P51178 756 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 LRRC41Q15345 812 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC42Q96M95 316 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 ZBTB7AO95365 584 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PPP2R5BQ15173 497 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 TBCKQ8TEA7 893 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 TAF4BQ92750 862 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 BICD1Q96G01 975 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 USP17L5A8MUK1 530 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 FAM13AO94988 1023 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 DDIT3P35638 169 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 MCM6Q14566 821 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 NIM1KQ8IY84 436 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 14
ZBED1-202ENST00000381222 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 ST3GAL1Q11201 340 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 DYNC1I1O14576 645 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 TPH2Q8IWU9 490 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 CEP95Q96GE4 821 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 AOC3Q16853 763 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.65■□□□□ 0.26
ZBED1-202ENST00000381222 A0A1W2PQ27 194 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 A0A1W2PQ64 194 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 A0A1W2PQD8 194 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 BACH1O14867 736 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 DDAH1O94760 285 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 NEK8Q86SG6 692 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 SEMA3EO15041 775 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 FAM212AQ96EL1 285 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 MEIS1O00470 390 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 TERF1P54274 439 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 VPS72Q15906 364 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 ALAS1P13196 640 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 TCHPQ9BT92 498 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 CARD6Q9BX69 1037 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 KIF20AO95235 890 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 BAG6P46379 1132 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 OR52Z1P0C646 297 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 GRIN1Q05586 938 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 PHACTR2O75167 634 aa16.62■□□□□ 0.25
ZBED1-202ENST00000381222 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms