RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 MAP3K11Q16584 847 aa29.53■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 KIF3CO14782 793 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 SLC1A4P43007 532 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 ELP3Q9H9T3 547 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 MTMR2Q13614 643 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 AIFM3Q96NN9 605 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 VCPKMTQ9H867 229 aa29.51■■■□□ 2.32
SNX15-202ENST00000377244 TRIM75PA6NK02 468 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 CYTH3O43739 400 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 SH2D4AQ9H788 454 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GOPCQ9HD26 462 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 MYH6P13533 1939 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.5■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 DCAF4Q8WV16 495 aa29.5■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GMCL1Q96IK5 515 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 WDR18Q9BV38 432 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 SLC16A2P36021 539 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GNAQP50148 359 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 USP17L10C9JJH3 530 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 SYT1P21579 422 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GJB4Q9NTQ9 266 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 STK36Q9NRP7 1315 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 BMP3P12645 472 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 BACE1P56817 501 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 CST9Q5W186 159 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 OTUD5Q96G74 571 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.45■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.45■■■□□ 2.31
SNX15-202ENST00000377244 HMGCS2P54868 508 aa29.45■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PKN1Q16512 942 aa29.45■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.45■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 ALG1Q9BT22 464 aa29.45■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.45■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 TMEM232C9JQI7 657 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 GUCY1B3Q02153 619 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PTPRFP10586 1907 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 DEXIO95424 95 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 HOMER1Q86YM7 354 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 STX6O43752 255 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 ERO1BQ86YB8 467 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 IRF6O14896 467 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 VCAM1P19320 739 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 YY1P25490 414 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 OPTNQ96CV9 577 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 KIF3AQ9Y496 699 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 USP14P54578 494 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PIGSQ96S52 555 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PDCP20941 246 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 FKBP1BP68106 108 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PPATQ06203 517 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 LPAR1Q92633 364 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 SHISA4Q96DD7 197 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 MTMR6Q9Y217 621 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 C8orf76Q96K31 380 aa29.4■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 GJA5P36382 358 aa29.39■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 PASKQ96RG2 1323 aa29.39■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SNX15-202ENST00000377244 SMARCA1P28370 1054 aa29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms