RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 MOGSQ13724 837 aa30.94■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM83BQ5T0W9 1011 aa30.94■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.94■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 TREML2Q5T2D2 321 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 KCTD1Q719H9 257 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA8AA7E2F4 631 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 STK3Q13188 491 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 NOGQ13253 232 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GRM4Q14833 912 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 FANCBQ8NB91 859 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 HPS5Q9UPZ3 1129 aa30.93■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 MCM2P49736 904 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 RCAN1P53805 252 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF543Q08ER8 600 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 MAP3K14Q99558 947 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 LARGE1O95461 756 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 ME3Q16798 604 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 ZIC5Q96T25 663 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 TANGO6Q9C0B7 1094 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 MAD2L2Q9UI95 211 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.91■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 AOC2O75106 756 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF5BP33176 963 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 CCT2P78371 535 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 RTN1Q16799 776 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 VEGFBP49765 207 aa30.89■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.89■■■□□ 2.54
GGTA1P-201ENST00000373793 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 BTBD19C9JJ37 291 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM232C9JQI7 657 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L15C9J2P7 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L11C9JVI0 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L18D6R9N7 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L22D6RA61 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L19D6RCP7 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L20D6RJB6 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L24Q0WX57 530 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SREBF2Q12772 1141 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 IKQ13123 557 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPN18Q99952 460 aa30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 NID2Q14112 1375 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 KLRF2D3W0D1 207 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PFKFB2O60825 505 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CDC27P30260 824 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 INHBEP58166 350 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SNX21Q969T3 373 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 FLOT1O75955 427 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 STAT2P52630 851 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SCRN1Q12765 414 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP2R5BQ15173 497 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD23Q86SG2 305 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 NECAB1Q8N987 351 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CPVLQ9H3G5 476 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 FEM1BQ9UK73 627 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PARP14Q460N5 1801 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 ADD1P35611 737 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC16A2P36021 539 aa30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PDHXO00330 501 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 PLEKHA8P1O95397 391 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 GNAQP50148 359 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 CHURC1Q8WUH1 139 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 TMX3Q96JJ7 454 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
GGTA1P-201ENST00000373793 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms