RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TECP42680 631 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TNNI1P19237 187 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA2Q9UL42 364 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA3EO15041 775 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH11Q8N954 259 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GLG1Q92896 1179 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CEP170Q5SW79 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 BTDP43251 543 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PRR16Q569H4 304 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 USTQ9Y2C2 406 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RDH13Q8NBN7 331 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MORC3Q14149 939 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PROSER3Q2NL68 480 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM58Q8NG06 486 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 DEPTORQ8TB45 409 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KRT19P08727 400 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO11Q86XK2 927 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF3O75054 1194 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 BAG6P46379 1132 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ICA1Q05084 483 aa22.39■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQ27 194 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQ64 194 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQD8 194 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 RASEFQ8IZ41 740 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2MP0CAP2 368 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIA1Q13136 1202 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FYB2Q5VWT5 728 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF15Q66K64 600 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CSADQ9Y600 493 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 METP08581 1390 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR3Q13615 1198 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CNKSR1Q969H4 720 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC17Q96LX7 622 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 AMFRQ9UKV5 643 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ALAS1P13196 640 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PTGDRQ13258 359 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 P4HA1P13674 534 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SCRN1Q12765 414 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA1Q5VX52 437 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LGSNQ5TDP6 509 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CYP21A2P08686 494 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 ADORA1P30542 326 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2J2P51589 502 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.37■■□□□ 1.17
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN13Q68D06 897 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms