RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 FOXP2O15409 715 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 RAD21O60216 631 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 PDE4BQ07343 736 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 PPARAQ07869 468 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM32Q13049 653 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TICAM2Q86XR7 235 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 MB21D1Q8N884 522 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 SGPL1O95470 568 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 TSPY8P0CW00 308 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 GRB14Q14449 540 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 VPS53Q5VIR6 699 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 RILPL2Q969X0 211 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 ATG4CQ96DT6 458 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 CEP95Q96GE4 821 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 NYAP2Q9P242 653 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 RPTORQ8N122 1335 aa9.1□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 PTPREP23469 700 aa9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 PLS1Q14651 629 aa9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 CCL14Q16627 93 aa9.1□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.1□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 F5H6K3 240 aa9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB10O96000 172 aa9.09□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 HOXC6P09630 235 aa9.09□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 ERCC3P19447 782 aa9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 ADORA2AP29274 412 aa9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TFAP4Q01664 338 aa9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 KLRC3Q07444 240 aa9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.09□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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SGMS1-201ENST00000361543 DPP9Q86TI2 863 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 MKL1Q969V6 931 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 STX8Q9UNK0 236 aa9.08□□□□□ -0.96
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