RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PICK1Q9NRD5 415 aa18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM1O75626 825 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GJA5P36382 358 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 WNK4Q96J92 1243 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 USP25Q9UHP3 1055 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PCNTO95613 3336 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMB1P07942 1786 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 UNCXA6NJT0 531 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TYRO3Q06418 890 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRYD7Q5W111 196 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 APOA5Q6Q788 366 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT23Q9C075 422 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SENP2Q9HC62 589 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SWAP70Q9UH65 585 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ADCY5O95622 1261 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GH2P01242 217 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRAP18433 802 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ERO1BQ86YB8 467 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 RGS22Q8NE09 1264 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 LY9Q9HBG7 655 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 DOCK1Q14185 1865 aa18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB43O43298 467 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CDKL5O76039 1030 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 AKR1B1P15121 316 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 LIFRP42702 1097 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 MYH8P13535 1937 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 IRF6O14896 467 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 NOGQ13253 232 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 BRAPQ7Z569 592 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CABP5Q9NP86 173 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 TOMM22Q9NS69 142 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ASNSP08243 561 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 RXRAP19793 462 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 RASA1P20936 1047 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC27P30260 824 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ME1P48163 572 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PPATQ06203 517 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE4BQ07343 736 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM75PA6NK02 468 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 USP17L5A8MUK1 530 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SEPT2Q15019 361 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 MICU3Q86XE3 530 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ALG1Q9BT22 464 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC69A6NI79 296 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 CTAGE5O15320 804 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 GUCY1A2P33402 732 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIL2Q13356 520 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 NTRK3Q16288 839 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.23■□□□□ 0.51
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms