RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MTA3Q9BTC8 594 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 SENP2Q9HC62 589 aa26.19■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 FLOT1O75955 427 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 BMP3P12645 472 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 GMCL1Q96IK5 515 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 TLR2O60603 784 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 CCDC96Q2M329 555 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 LY9Q9HBG7 655 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 HERVK_113P62684 666 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 CPA4Q9UI42 421 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.16■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 BACH2Q9BYV9 841 aa26.16■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC69A6NI79 296 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM232C9JQI7 657 aa26.14■■□□□ 1.78
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HOXD4-201ENST00000306324 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.13■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 FEM1BQ9UK73 627 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 GPR25O00155 361 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 SNHG28P0DPA3 235 aa26.12■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 C17orf99Q6UX52 265 aa26.12■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF543Q08ER8 600 aa26.11■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 ATG4CQ96DT6 458 aa26.11■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 MYH6P13533 1939 aa26.11■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 MYL10Q9BUA6 226 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 MGAMO43451 1857 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 PEX10O60683 326 aa26.1■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 LBX1P52954 281 aa26.1■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.09■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 DDAH1O94760 285 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.08■■□□□ 1.77
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