RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 IFNKQ9P0W0 207 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FAM205CA6NFA0 338 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 MYL5Q02045 173 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SLF2Q8IX21 1173 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 TEKT1Q969V4 418 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 USP40Q9NVE5 1235 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FLT1P17948 1338 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 BMP15O95972 392 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 KIF5BP33176 963 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 ARID5BQ14865 1188 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 POSTNQ15063 836 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 CSRNP2Q9H175 543 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SCG2P13521 617 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 PRELPP51888 382 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 TFAP4Q01664 338 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 NPY5RQ15761 445 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 KAT14Q9H8E8 782 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FOXN1O15353 648 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SLURP2P0DP57 97 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SOGA3Q5TF21 947 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 KANK3Q6NY19 840 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 DGKHQ86XP1 1220 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 NIM1KQ8IY84 436 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 TNFRSF25Q93038 417 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 SKILP12757 684 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 NFIAQ12857 509 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FANCCQ00597 558 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 CERS3Q8IU89 383 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 FERMT2Q96AC1 680 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNS3-201ENST00000304101 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CCZ1BP86790 482 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 PDILTQ8N807 584 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 MYO1BO43795 1136 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 USP49Q70CQ1 688 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ANKS1AQ92625 1134 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ATP1A3P13637 1013 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 PLCG2P16885 1265 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 BMP6P22004 513 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 NLRP5P59047 1200 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TCP10Q12799 353 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TTC38Q5R3I4 469 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 PNMA1Q8ND90 353 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 SMARCE1Q969G3 411 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 SHTN1A0MZ66 631 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CXCL9Q07325 125 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TMC6Q7Z403 805 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 PRR29P0C7W0 189 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TSPY3P0CV98 308 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TSPY8P0CW00 308 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TRAPPC10P48553 1259 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 CFAP100Q494V2 611 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
KCNS3-201ENST00000304101 DACH1Q9UI36 760 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms