RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 LUZP1Q86V48 1076 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 CBX8Q9HC52 389 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 CALML3P27482 149 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 BLIDQ8IZY5 108 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 BARHL2Q9NY43 387 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SIPA1L1O43166 1804 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP3O00186 592 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 HOMER1Q86YM7 354 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.09■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 POLD1P28340 1107 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF174Q15697 407 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 GMLQ99445 158 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 MTFR1LQ9H019 292 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2B2Q01814 1243 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 TTC38Q5R3I4 469 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC17Q96LX7 622 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PSME4Q14997 1843 aa26.07■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 AP5Z1O43299 807 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SNHG28P0DPA3 235 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF165P49910 485 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 STX1AQ16623 288 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SOGA3Q5TF21 947 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCA1P28370 1054 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PLCB2Q00722 1185 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 TIGD1Q96MW7 591 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PIGSQ96S52 555 aa26.06■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE6P0CI01 402 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 NIM1KQ8IY84 436 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CSRNP2Q9H175 543 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 VPS33BQ9H267 617 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 M0R2N6 131 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ENTPD3O75355 529 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY5O95622 1261 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.05■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.05■■□□□ 1.76
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VSTM4-201ENST00000298454 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.04■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.04■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CLRN2A0PK11 232 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC10P48553 1259 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 USP49Q70CQ1 688 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 OGFOD1Q8N543 542 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ANO10Q9NW15 660 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.03■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 NAPAP54920 295 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 DLGAP5Q15398 846 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 CAVIN2O95810 425 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 BMP15O95972 392 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF543Q08ER8 600 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 PTGDRQ13258 359 aa26.02■■□□□ 1.76
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT17Q6IS24 598 aa26.02■■□□□ 1.76
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VSTM4-201ENST00000298454 MCM7P33993 719 aa26.01■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.01■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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VSTM4-201ENST00000298454 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.01■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CNNM3Q8NE01 707 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 TMOD2Q9NZR1 351 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 BIN1O00499 593 aa26■■□□□ 1.75
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL9Q07325 125 aa26■■□□□ 1.75
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