RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 MMP19Q99542 508 aa9.58□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.58□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC184Q52MB2 194 aa9.56□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.56□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR108Q9NPR9 543 aa9.56□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 FOCADQ5VW36 1801 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.55□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 DDX11Q96FC9 970 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 PBX2P40425 430 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA10Q16322 511 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-201ENST00000296642 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.53□□□□□ -0.88
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PGGT1B-201ENST00000296642 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF28PB7ZC32 967 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR37L1O60883 481 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ASGR1P07306 291 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ACRP10323 421 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTN1P12814 892 aa9.52□□□□□ -0.89
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