RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 AGLP35573 1532 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 HGSO14964 777 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV5-2P06315 115 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 HOXC9P31274 260 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 GCKRQ14397 625 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 NELFBQ8WX92 580 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC42Q96M95 316 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 EPB41L5Q9HCM4 733 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 INCENPQ9NQS7 918 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 NCK2O43639 380 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 KRT26Q7Z3Y9 468 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM47Q96LD4 638 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 MYBL1P10243 752 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 CRYMQ14894 314 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 ARMC2Q8NEN0 867 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRR-201ENST00000283228 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 AKR1B10O60218 316 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 IDH1O75874 414 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 MOCS3O95396 460 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF174Q15697 407 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K14Q99558 947 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 NEURL1BA8MQ27 555 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ANTXR2P58335 489 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 DDR1Q08345 913 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PAK1Q13153 545 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PTGISQ16647 500 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PTPROQ16827 1216 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PLIN2Q99541 437 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD14O00487 310 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TMOD1P28289 359 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SPAG1Q07617 926 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL7Q8IXQ5 586 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA4Q8NEY3 305 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 STIM2Q9P246 746 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 BUB1O43683 1085 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 AP1G2O75843 785 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 GUCY1A2P33402 732 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 C21orf2O43822 256 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PTPREP23469 700 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SLC8A1P32418 973 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 HERVK_113P62684 666 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ACCSLQ4AC99 568 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ALS2CLQ60I27 953 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 APOA5Q6Q788 366 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PI16Q6UXB8 463 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 OR2W6PQ8NHA6 318 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PAGE5Q96GU1 130 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SH3GL2Q99962 352 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM75PA6NK02 468 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 A6NNZ2 444 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 CYFIP2Q96F07 1278 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 ALS2CR12Q96Q35 445 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 PTPRUQ92729 1446 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM23A6NLE4 172 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 GPAA1O43292 621 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 MDH1P40925 334 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms