RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KAT14Q9H8E8 782 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP2R5BQ15173 497 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 VCPKMTQ9H867 229 aa23.62■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK36Q9NRP7 1315 aa23.6■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOPCQ9HD26 462 aa23.6■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGS22Q8NE09 1264 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZIC5Q96T25 663 aa23.59■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDHBP11177 359 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP14P54578 494 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAPC2Q13487 334 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.58■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.58■■□□□ 1.37
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCTD1Q719H9 257 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC1A4P43007 532 aa23.57■■□□□ 1.36
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC102AQ96A19 550 aa23.57■■□□□ 1.36
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