RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 CMA1P23946 247 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 BTBD18B2RXH4 712 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SMTNP53814 917 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TMCO4Q5TGY1 634 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 KIFC2Q96AC6 838 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TRIML1Q8N9V2 468 aa7□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PLCG2P16885 1265 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ATP5JP18859 108 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SNCBQ16143 134 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 RBL2Q08999 1139 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 FGAP02671 866 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 CABP7Q86V35 215 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 USTQ9Y2C2 406 aa6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 GNA14O95837 355 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 LIN9Q5TKA1 542 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 EXOC3O60645 756 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-201ENST00000267176 COG7P83436 770 aa6.98□□□□□ -1.29
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