RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ELF1P32519 619 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 EHHADHQ08426 723 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MAGEB6Q8N7X4 407 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 FAM212AQ96EL1 285 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 SCINQ9Y6U3 715 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MX2P20592 715 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 TNNI3KQ59H18 835 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ESRRGP62508 458 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GEN1Q17RS7 908 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 WDR78Q5VTH9 848 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ST7Q9NRC1 585 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 RNF14Q9UBS8 474 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MYO1EQ12965 1108 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CLIC4Q9Y696 253 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GRK7Q8WTQ7 553 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 E7EWF7 191 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PHBP35232 272 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ADCY8P40145 1251 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PLS1Q14651 629 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PTPN21Q16825 1174 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ABCC4O15439 1325 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 KBTBD3Q8NAB2 608 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 NLRP7Q8WX94 980 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GGCXP38435 758 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GSTO1P78417 241 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 USP19O94966 1318 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WWV3 80 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 TRAF1Q13077 416 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ST5P78524 1137 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 SATB1Q01826 763 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 HVCN1Q96D96 273 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PTPROQ16827 1216 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CCDC93Q567U6 631 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ATP2A3Q93084 1043 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PANX2Q96RD6 677 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 FAM167BQ9BTA0 163 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 GNA14O95837 355 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 DYMQ7RTS9 669 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 LRRC43Q8N309 656 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MIGA1Q8NAN2 632 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CCT6BQ92526 530 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 APPBP2Q92624 585 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 DBNDD2Q9BQY9 259 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MYL10Q9BUA6 226 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 RASSF7Q02833 373 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CLIC6Q96NY7 704 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ZFYVE9O95405 1425 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 HLA-DOAP06340 250 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CABP7Q86V35 215 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PALM2Q8IXS6 379 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PASKQ96RG2 1323 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 NME8Q8N427 588 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 RASSF10A6NK89 507 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 MBD4O95243 580 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 KSR1Q8IVT5 923 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 BATF3Q9NR55 127 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 TXKP42681 527 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 PPP2R5BQ15173 497 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 CRCPO75575 148 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 BCRP11274 1271 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-201ENST00000256413 AKNAD1Q5T1N1 836 aa17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms