RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043498.7

Hdac3-201, Transcript of Histone deacetylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hdac3, Length 2,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Vgll2Q8BGW8 322 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mknk2Q8CDB0 459 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Plcg2Q8CIH5 1265 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Usp33Q8R5K2 909 aa26.69■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rsph3aQ3UFY4 516 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Armc6Q8BNU0 468 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tph1P17532 447 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Arhgef2Q60875 985 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MyripQ8K3I4 856 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdca7Q9D0M2 382 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 AllcQ9JHX6 414 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tob2Q9JM55 345 aa26.68■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 LdhbP16125 334 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atp13a3Q5XF89 1219 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Trnp1Q80ZI1 223 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 RadxQ8C779 850 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Wasf1Q8R5H6 559 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 BaatQ91X34 420 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Srgap1Q91Z69 1062 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stx6Q9JKK1 255 aa26.67■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Snap25P60879 206 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pls1Q3V0K9 630 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Galnt17Q7TT15 598 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrrc24Q8BHA1 521 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sapcd2Q9D818 391 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ulk4Q3V129 1303 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pfkfb3A7UAK5 555 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pxylp1Q8BHA9 480 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Vta1Q9CR26 309 aa26.66■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 DaxxO35613 739 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 FlgP11088 336 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Traf1P39428 409 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm45015A0A140LII9 184 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm18336A0A140LIU8 765 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rexo5D3YW29 759 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Flot1O08917 428 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zdhhc9P59268 364 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MslnlQ8C160 685 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Syne4Q8CII8 388 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fsip1Q9D3V5 435 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Psmd10Q9Z2X2 231 aa26.65■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Armc3A2AU72 881 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 TrdnE9Q9K5 693 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 VegfbP49766 207 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 LyarQ08288 388 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam83hQ148V8 1209 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gprasp2Q8BUY8 826 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Morc2bQ8C5W4 1022 aa26.64■■□□□ 1.86
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Scn3aA2ASI5 1947 aa26.64■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Plcg1Q62077 1302 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Skint3A7TZF0 458 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Il13ra2O88786 383 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 GabpaQ00422 454 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc27a1Q60714 646 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zfp113Q8C689 439 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 SdsQ8VBT2 327 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cd2apQ9JLQ0 637 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Igsf9bE9PZ19 1328 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dnai2A2AC93 623 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Traf5P70191 558 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rhpn1Q61085 643 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ccdc82Q6PG04 518 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ano1Q8BHY3 960 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdan1Q8CC12 1239 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Onecut3Q8K557 490 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Oxnad1Q8VE38 311 aa26.63■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dnaaf5B9EJR8 853 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Usp17ldG5E8G2 545 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Usp17lcG5E8I7 545 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kcna1P16388 495 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ccnd3P30282 292 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nol12Q8BG17 217 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kcnj14Q8JZN3 434 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fez1Q8K0X8 392 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tjp3Q9QXY1 905 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Btbd19S4R1I0 287 aa26.62■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MthfslL7N466 203 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Spryd7Q3TFQ1 196 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ptger2Q62053 362 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dnm1P39053 867 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gdf10P97737 476 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Depdc1aQ8CIG0 804 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nr3c2Q8VII8 978 aa26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cyp3a25O09158 503 aa26.6■■□□□ 1.85
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Oxr1Q4KMM3 866 aa26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.3 ms