RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spire2Q8K1S6 718 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TicrrQ8BQ33 1889 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Flvcr1B2RXV4 560 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r68L7N2B3 851 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Copb2O55029 905 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt7aP24383 349 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LrmpQ60664 539 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf653Q6YND2 615 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WdpcpQ8C456 722 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt112Q9DCG9 125 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myh14Q6URW6 2000 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrcapA0A087WQ44 3271 aa14.36□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grin1P35438 938 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnd1Q03719 651 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q66JV7 365 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trak2Q6P9N8 913 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd14O35593 310 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmnnO88513 206 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtel1Q0VGM9 1203 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wasf1Q8R5H6 559 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scg2Q03517 617 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo19Q5SV80 963 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mns1Q61884 491 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps37dQ810I0 261 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Haus7Q8BKT8 364 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmynd15Q8C0R7 736 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Filip1Q9CS72 1211 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GdaQ9R111 454 aa14.35□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam186bD3Z420 943 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eddm13E9Q7F5 164 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10134F6ZQC6 126 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam7O35227 789 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vcam1P29533 739 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc2Q3URY6 854 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C87499Q3UX49 493 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt39Q6IFX4 482 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lonp2Q9DBN5 852 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChmQ9QXG2 665 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan18E9PUD6 809 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a25O09158 503 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glra4Q61603 456 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam76aQ922G2 307 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd1Q9CR42 319 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BccipQ9CWI3 316 aa14.34□□□□□ -0.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp8b5A3FIN4 1183 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phldb3E9QAF4 648 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dapk3O54784 448 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcna1P16388 495 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef2Q60875 985 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctdspl2Q8BG15 465 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RadxQ8C779 850 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mboat7Q8CHK3 473 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Evc2Q8K1G2 1220 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfap4Q9JIZ5 338 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif2aP28740 705 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sap30bpQ02614 308 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Madcam1Q61826 405 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Drc7Q6V3W6 876 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl30Q8C3F7 581 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubgcp2Q921G8 905 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NenfQ9CQ45 171 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Desi2Q9D291 194 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem79Q9D709 391 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp21Q9QZL6 566 aa14.33□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc121E9Q6D3 323 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp597E9Q6S0 419 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D1Pas1P16381 660 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmtc2Q56A06 836 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd40Q5SUE8 363 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnptabQ69ZN6 1235 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd3Q8BFX3 815 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8CEZ4 452 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek9Q8K1R7 984 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps16Q920Q4 839 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy1a2F8VQK3 730 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NefhP19246 1090 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamb1P02469 1786 aa14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap70D3YVL2 1141 aa14.31□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5624F6ZZG8 207 aa14.31□□□□□ -0.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gng11P61953 73 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms