RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.14□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 STXBP3O00186 592 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CREB3O43889 395 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 EMC10Q5UCC4 262 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NBPF15Q8N660 670 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 TEKT4Q8WW24 435 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 MAP4K1Q92918 833 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NR1D1P20393 614 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PIDD1Q9HB75 910 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 POLD4Q9HCU8 107 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 LRRD1A4D1F6 860 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 RASSF10A6NK89 507 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CAPN15O75808 1086 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SASH1O94885 1247 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ABL1P00519 1130 aa13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CLTAP09496 248 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 HVCN1Q96D96 273 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PDLIM1O00151 329 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 KIF5BP33176 963 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 GJA8P48165 433 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 MXRA7P84157 204 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 DEUP1Q05D60 604 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 IQCEQ6IPM2 695 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CAGE1Q8TC20 777 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CNKSR1Q969H4 720 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CAPZA3Q96KX2 299 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.12□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 FAM83GA6ND36 823 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 KRT14P02533 472 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 GHRP10912 638 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ABL2P42684 1182 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 TEX9Q8N6V9 391 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 C2CD2Q9Y426 696 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 GMNCA6NCL1 334 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ENC1O14682 589 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CNGA1P29973 690 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 Q4G0T1 1027 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 DPPA5A6NC42 116 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 EPHB4P54760 987 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 RBL2Q08999 1139 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 EMBQ6PCB8 327 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PHC3Q8NDX5 983 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ZIM3Q96PE6 472 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.11□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 FYB1O15117 783 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SPTLC2O15270 562 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 APBA1Q02410 837 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC63Q8NA47 563 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 AGAP11Q8TF27 550 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 HINFPQ9BQA5 517 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SRGAP2O75044 1071 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PFKFB1P16118 471 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 MYBPC2Q14324 1141 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NR1I3Q14994 352 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NUB1Q9Y5A7 615 aa13.1□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 NUTM2FA1L443 756 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PSMD14O00487 310 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 MAP3K13O43283 966 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 PPIP5K2O43314 1243 aa13.09□□□□□ -0.31
SPIN3-241ENST00000640511 CMA1P23946 247 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms