RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624872.1

CU639417.6-202, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU639417.6, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-202ENST00000624872 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SNAP23O00161 211 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ARHGAP25P42331 645 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.52□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 KRT2P35908 639 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SPATA5Q8NB90 893 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CHP1Q99653 195 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 GLI3P10071 1580 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SEMA3EO15041 775 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RNF40O75150 1001 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CTSWP56202 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 UBXN1Q04323 297 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 LCORLQ8N3X6 602 aa14.51□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 WNT7AO00755 349 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TFR2Q9UP52 801 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TUBBP07437 444 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 HLFQ16534 295 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 LRRC31Q6UY01 552 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TMTC2Q8N394 836 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MED4Q9NPJ6 270 aa14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 KCNJ18B7U540 433 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SRGAP2O75044 1071 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PAK1Q13153 545 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 KCNJ12Q14500 433 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MYH8P13535 1937 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ZMYND10O75800 440 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 AMPD2Q01433 879 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RASGRF1Q13972 1273 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 NELFBQ8WX92 580 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 FERMT2Q96AC1 680 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SHISA4Q96DD7 197 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 NDUFA10O95299 355 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 SPAG1Q07617 926 aa14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TNKSO95271 1327 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MST1RQ04912 1400 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PTGDRQ13258 359 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 LPIN2Q92539 896 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MMS19Q96T76 1030 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 XDHP47989 1333 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TRIM14Q14142 442 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 TTC38Q5R3I4 469 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 WDR93Q6P2C0 686 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 NLRP10Q86W26 655 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 CAGE1Q8TC20 777 aa14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 FECHP22830 423 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 USP14P54578 494 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 MAP9Q49MG5 647 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 EFCC1Q9HA90 598 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 RPS6KA5O75582 802 aa14.47□□□□□ -0.09
CU639417.6-202ENST00000624872 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms