RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAP3K12Q12852 859 aa21.45■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.45■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ACER1Q8TDN7 264 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIFAQ96CG3 184 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.44■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 USP14P54578 494 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNRKQ9NRH2 765 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CRBNQ96SW2 442 aa21.39■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.34■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-209ENST00000616395 USP5P45974 858 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1W2PRG0 241 aa21.31■■□□□ 1
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