RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASP1P29466 404 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC38Q5R3I4 469 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFF2P51816 1311 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFMP43652 599 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLCD1P51178 756 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BAG3O95817 575 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNMA1Q8ND90 353 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.83■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM232C9JQI7 657 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SERPINB2P05120 415 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GYS1P13807 737 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GSTO1P78417 241 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTGDRQ13258 359 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD209Q9NNX6 404 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPY3P0CV98 308 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPY8P0CW00 308 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF5BP33176 963 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MCM7P33993 719 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MORC3Q14149 939 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP135Q66GS9 1140 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH6P13533 1939 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ST5P78524 1137 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STX8Q9UNK0 236 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BTDP43251 543 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STAMQ92783 540 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GGA1Q9UJY5 639 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPN14Q15678 1187 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KANK3Q6NY19 840 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DGKHQ86XP1 1220 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FERMT2Q96AC1 680 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CBFA2T2O43439 604 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MLKLQ8NB16 471 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAGE5Q96GU1 130 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF20AO95235 890 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADRA2BP18089 450 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LY75O60449 1722 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAMB1P07942 1786 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LDHCP07864 332 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLFN14P0C7P3 912 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP4CP60510 307 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRY2Q49AN0 593 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MED15Q96RN5 788 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INTS13Q9NVM9 706 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BMP15O95972 392 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLLQ9UGP5 575 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGSF3O75054 1194 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP2B4P23634 1241 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX11Q8IYF3 940 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPVLQ9H3G5 476 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C6orf229H3BNL8 230 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL17AQ16552 155 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CERKQ8TCT0 537 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DACH1Q9UI36 760 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SBF2Q86WG5 1849 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASA1P20936 1047 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VSTM4Q8IW00 320 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms