RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CPA4Q9UI42 421 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L15C9J2P7 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L11C9JVI0 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L18D6R9N7 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L22D6RA61 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L19D6RCP7 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L20D6RJB6 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 E7EWF7 191 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC27A2O14975 620 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 REC8O95072 547 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP17L24Q0WX57 530 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RNF20Q5VTR2 975 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CREB3L3Q68CJ9 461 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LPAR1Q92633 364 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TAF6LQ9Y6J9 622 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 F5H6K3 240 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FKTNO75072 461 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KLRC3Q07444 240 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NECTIN1Q15223 517 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IQCA1Q86XH1 822 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MKL1Q969V6 931 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NT5C2P49902 561 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SP3Q02447 781 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NCOA7Q8NI08 942 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MTMR7Q9Y216 660 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYH4Q9Y623 1939 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NDUFB10O96000 172 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC178Q5BJE1 867 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C17orf99Q6UX52 265 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FLOT1O75955 427 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HERVK_113P62684 666 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLFN13Q68D06 897 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TTC14Q96N46 770 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COG2Q14746 738 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF22Q14807 665 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHST3Q7LGC8 479 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TNKSO95271 1327 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BCRP11274 1271 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MCCP23508 829 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DGKHQ86XP1 1220 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERO1AQ96HE7 468 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERICH2A1L162 156 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BMP3P12645 472 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC1A4P43007 532 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NOVP48745 357 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RASEFQ8IZ41 740 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KAT14Q9H8E8 782 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PEX10O60683 326 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MCM5P33992 734 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms