RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 BTBD7Q9P203 1132 aa27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 H0YGN5 161 aa27.93■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.93■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 OSBP2Q969R2 916 aa27.93■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 TMX2Q9Y320 296 aa27.93■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 ERC2O15083 957 aa27.92■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 SBK1Q52WX2 424 aa27.92■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 TANGO6Q9C0B7 1094 aa27.92■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.91■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.91■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 DPF3Q92784 378 aa27.91■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.91■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 MAP2K5Q13163 448 aa27.9■■■□□ 2.06
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MBD3-211ENST00000592965 GNAT2P19087 354 aa27.89■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 CRBNQ96SW2 442 aa27.89■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 GRB14Q14449 540 aa27.88■■■□□ 2.05
MBD3-211ENST00000592965 CCL14Q16627 93 aa27.88■■■□□ 2.05
MBD3-211ENST00000592965 WDR78Q5VTH9 848 aa27.88■■■□□ 2.05
MBD3-211ENST00000592965 MB21D1Q8N884 522 aa27.88■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.87■■■□□ 2.05
MBD3-211ENST00000592965 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 HOXC6P09630 235 aa27.86■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 NR2E3Q9Y5X4 410 aa27.85■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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MBD3-211ENST00000592965 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.82■■■□□ 2.04
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MBD3-211ENST00000592965 MROH8Q9H579 483 aa27.8■■■□□ 2.04
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MBD3-211ENST00000592965 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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MBD3-211ENST00000592965 NPLOC4Q8TAT6 608 aa27.79■■■□□ 2.04
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