RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	BRCA2	P51587	3418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326		A0A1W2PRG0	241 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	STRN	O43815	780 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CYP2D6	P10635	497 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	EVX2	Q03828	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	GABPA	Q06546	454 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	RAD21	O60216	631 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	FLOT1	O75955	427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	HOXC6	P09630	235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ERCC3	P19447	782 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ADORA2A	P29274	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MYH1	P12882	1939 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DNM1L	O00429	736 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PRKAB2	O43741	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MBD4	O95243	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	AKR1B1	P15121	316 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DSG3	P32926	999 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ICA1	Q05084	483 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MROH8	Q9H579	483 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CYBA	P13498	195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	RTP1	P59025	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	COBL	O75128	1261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	FCER1A	P12319	257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	ADD2	P35612	726 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CDK8	P49336	464 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP36-223	ENST00000592326	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	USP17L21	D6R901	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SEPT4	O43236	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	MMP19	Q99542	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SLC25A27	O95847	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ATP5J	P18859	108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	KCTD2	Q14681	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP36-223	ENST00000592326	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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